Acho que carro batido é mais sofrível, apesar das técnicas de reparação nos dias de hj são no padrão das montadoras.
E tem outra, na linha de montagem podem ocorrer danos na lataria do carro, eles são recuperados dentro da fabrica e ate mesmo na CCS. E muitas vezes compramos sem perceber isso.
Mas se for bem feito o reparo... esta tudo bem
Agora em tratar de motor, não vejo nada que desmereça um carro com reparo feito nele. Nada ira mudar, e tem outra, o motor esta fechado dentro do cofre, sujeito a poeira e sujeira, ou seja, nunca vc vera sinais de que o cabeçote for substituído.
Ao meu ver, não se preocupe com isso, seu carro não perderá valor de mercado do ja perdeu devido a desvalorização normal de um zero km.
Outra, so vc sabe da troca, na hora de se desfazer dele, isso não precisa ser evidenciado, ate porque se o motor estiver ok o próximo dono ficara feliz.
Agora concordo que se trocarem e não ficar bom, consulte o CDC junto a um advogado e arrente com a montadora.